ELANで書き出したラベルファイルをExcelで読み込む件で、
読み込みがうまくいかないのは、やはりファイルの文字コードの問題でした。
Shift-JISコードのテキストファイルのみ正しく読めるようです。
しかし、Excelでテキストファイルを読み込むときに文字コードを指定しても、エラーが出てしまいます。

そこで、事前にテキストファイルの文字コードの変換処理をしてください。
以下のページの、「最新版ダウンロード sinst1-6-3-0.exe (1.6.3.0)」をダウンロードしてください。
http://members.at.infoseek.co.jp/sakura_editor/snapshot.html

.exeファイルをダブルクリックして、「サクラエディタ」をインストールしてください。
文字コードを変換したいテキストファイルを「サクラエディタ」で開き、
「ファイル」＞「名前をつけて保存」＞「文字コードセット」を「SJIS」に変更して保存

これでテキストファイルの文字コードがShift-JIS形式になります。
Excel で読み込めるようになりますので、下のリンク先の手順に従って、2列目を除去して、ELANに読み込ませてみてください。

http://shower.human.waseda.ac.jp/~m-kouki/pukiwiki_public/index.php?ELAN%E3%81%AB%E3%82%88%E3%82%8B%E5%8B%95%E7%94%BB%E8%A7%A3%E6%9E%90%E3%81%AE%E6%89%8B%E9%A0%86#rc57b9cc

これで、うまくいくと思います。